Der private Kfz-Verkehr ist auf der gesamten Insel verboten.
Für öffentliche Aufgaben und landwirtschaftliche Nutzung sind nur wenige Kraftfahrzeuge zugelassen.
Dadurch ist die Insel nahezu autofrei.
Ein Teil der zugelassenen Fahrzeuge ist mit Elektroantrieb ausgestattet.
Der Großteil des Personenverkehrs, sowie ein Teil des Warenverkehrs werden mit Pferdefuhrwerken durchgeführt.
Zwischen den Ortsteilen Grieben, Kloster, Vitte und Neuendorf verkehrt ein Linienbus der Rügener Personennahverkehrs GmbH (RPNV).
Zu erreichen ist die Insel von Stralsund, sowie von Schaprode auf Rügen mit Personenfähren der „Reederei Hiddensee“, die in Kloster, Vitte und Neuendorf anlegen.
In der Sommersaison bestehen weitere Verbindungen mit Breege, Wiek und Zingst.
Außerdem gibt es noch Wassertaxiverbindungen mit dem Festland und der Insel Rügen.